Alternativer Identifier:
-
Verwandter Identifier:
(Is Supplement To) 10.1109/TCBB.2022.3156805 - DOI
Ersteller/in:
Klosa, Jan https://orcid.org/0000-0001-9135-4442 [Leibniz Institute for Farm Animal Biology (FBN)]

Wittenburg, Dörte https://orcid.org/0000-0002-3639-2574 [Leibniz Institute for Farm Animal Biology (FBN)]
Beitragende:
-
Titel:
Supplemental data to publication "A Fitted Sparse-Group Lasso for Genome-Based Evaluations"
Weitere Titel:
(Subtitle) Simulated data for genomic evaluations in breeding populations
Beschreibung:
(Abstract) A simulation study has been conducted to analyse the association between genetic and phenotypic variation with grouped penalization approaches. The study design resembles a breeding population consisting of several half-sib families which is typical, for example, in livestock or crop. Genotypes and phenotypes have been simulated with publicly available software. Two strategies have been followed to generate genetic effects captured by markers: effects have been sampled independently (option a) or in groups (option b). The dataset includes a detailed description of the simulation design and comprises phased genotypes of parents and progeny, progeny phenotypes and marker effect sizes. The simulation has been repeated 100 times.
Schlagworte:
SNP marker, genomic selection, statistical genetics, linkage disequilibrium
Zugehörige Informationen:
-
Sprache:
Englisch
Herausgeber/in:
Leibniz Institute for Farm Animal Biology (FBN), Wilhelm-Stahl-Allee 2, 18196 Dummerstorf, Germany
Erstellungsjahr:
Fachgebiet:
Agriculture
Biology
Life Science
Genetics
Objekttyp:
(Dataset) phenotypic and genetic data
Datenquelle:
-
Verwendete Software:
Software für Datenerhebung
Software:
AlphaSim - 1.05
Alternative Software:
R - 3.6.2
Verwendete Software:
Software für Datenbearbeitung
Software:
R - 3.6.2
Alternative Software:
-
Datenverarbeitung:
-
Erscheinungsjahr:
Rechteinhaber/in:
Leibniz Institute for Farm Animal Biology (FBN), Wilhelm-Stahl-Allee 2, 18196 Dummerstorf, Germany
Förderung:
Deutsche Forschungsgemeinschaft - (Multicollinearity in the statistical genomics era: Proposals to account for dependencies between molecular covariates with application to animal breeding)(DFG WI 4450/2-1)
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März 2024 15 0
Feb. 2024 22 0
Jan. 2024 18 0
Vorher 224 4
Gesamt 345 7
Status:
Publiziert
Eingestellt von:
wittenburg
Erstellt am:
Archivierungsdatum:
2021-04-12
Archivgröße:
27,0 GB
Archiversteller:
radarfbn
Archiv-Prüfsumme:
0a95cce77bc614bb897cb82d7041e57e (MD5)
Ende des Embargo-Zeitraums:
-